Главный герой этой истории — огромный бык по кличке Фердинанд, который с самого детства совершенно не похож на своих сородичей. Вместо того чтобы тратить время на тренировки и бодания, он предпочитал сидеть под цветущим цветочным деревом, любоваться бабочками и заботиться о маленьких друзьях — трёх козях, с которыми он рос на ферме семьи Флорес в Испании.
Жизнь главных героев мультфильма сильно изменилась за время, прошедшее с предыдущих частей: мамонт Манфред и его подруга Элли готовятся к рождению первого детёныша, а саблезубый тигр Диего задумывается, не потерял ли он свою былую свирепость, постоянно общаясь с мирными обитателями ледникового мира.