Убийство молодой офицерки Элизабет Кэмпбелл, дочери прославленного генерала ВС США, найденной мертвой в оружейной комнате военной базы, изначально квалифицируют как самоубийство. Но командование сомневается в версии о добровольном уходе из жизни, поэтому расследование поручают Полу Бреннеру — опытному военному следователю, который раньше уже работал с отцом погибшей и знает все особенности...
Действие фильма разворачивается спустя двести лет после событий, произошедших на планете-тюрьме Fury 161, где погибла последняя Эллен Рипли. Группа ученых под контролем военного командования на борту корабля 'Одиссея' проводит эксперимент по клонированию Рипли, чтобы получить генетический материал королевы Чужих и создать идеальное биологическое оружие.