Действие разворачивается в середине 1930-х годов, в разгар Великой депрессии, на улицах Нью-Йорка, где нищета и законность ходят рука об руку с криминальными структурами. Обычный уличный мальчишка Билли Батгейт, который с детства знал, что честный заработок в таких условиях — большая редкость, случайно попадает в поле зрения знаменитого босса мафии Голландца Шульца.
Это первая экранизация популярного комикса о героях, которая вышла в прокат в 1990 году и стала основой для целой медиафраншизы. После контакта с радиоактивными отходами в нью-йоркской канализационной системе четыре обычные домашние черепахи превращаются в разумных гуманоидов, а их наставник — крыса Сплитер, ранее жившая у мастера ниндзя-дзюцу — обучает их боевым искусствам и даёт имена...