После событий второго фильма команда Людей Икс под руководством Чарльза Ксавьера пытается построить мирное сосуществование мутантов и обычных людей, но на пути встаёт сразу несколько угроз: правительство США разрабатывает препарат, способный полностью лишить мутантов их сверхспособностей, а часть самих мутантов недовольна попытками «приспособиться» к обществу, которое их ненавидит и боится.
История начинается с того, что много лет назад маленький любопытный мальчик случайно попал в мешок с подарками Санта-Клауса и отправился вместе с ним на Северный полюс. Там его нашел и усыновил один из лесных эльфов, дал имя Бадди, и ребенок вырос среди волшебных существ, веря, что он такой же представитель племени, как и все остальные.