События картины разворачиваются спустя несколько лет после масштабной битвы в Чикаго, в ходе которой человечество понесло колоссальные потери. Автоботы и Десептиконы, развернувшие глобальную войну на территории планеты, практически исчезли из поля зрения общественности, а власти всех стран мира начинают охоту на оставшихся кибертронян, считая их не меньшей угрозой, чем самих врагов.
История разворачивается после того, как обычный парень Шон случайно становится свидетелем убийства прокурора, совершенного влиятельным гангстером Эдди Кимом. Вскоре в его квартире появляются наемные убийцы, и только вмешательство агента ФБР Невилла Флинна спасает парню жизнь. Полицейский уговаривает Шона полететь вместе с ним из Гонолулу в Лос-Анджелес, чтобы дать показания против бандита —...