Жизнь главных героев мультфильма сильно изменилась за время, прошедшее с предыдущих частей: мамонт Манфред и его подруга Элли готовятся к рождению первого детёныша, а саблезубый тигр Диего задумывается, не потерял ли он свою былую свирепость, постоянно общаясь с мирными обитателями ледникового мира.
Теплым сентябрьским вечером семья профессора колледжа Итана Лернера приходит на концерт, где их 10-летний сын Джош играет на виолончели, вызывая гордость у родителей и восхищение у младшей сестры. По возвращению домой они делают остановку на бензоколонке у Заповедной дороги — и эта короткая пауза становится точкой невозврата в их жизни.