Сотни лет люди живут в глубоких пещерах, скрываясь от землетрясений и обвалов, и почти забыли, что за толщей камней существует мир под открытым небом. В одной из таких подземных деревень живет Симон — тихий подросток, который помогает старшим в разработке тоннелей, и его наставник Камина, уверенный, что наверху ждет свободная жизнь без постоянной угрозы гибели.
История разворачивается в послевоенной Японии 1950-х, когда семья из четырех человек переезжает в старый деревенский дом, чтобы быть ближе к больнице, где лечится мама девочек. Две сестры, старшая Сацуки и младшая Мэй, активно исследуют окрестности: старый сад с огромным гинкго, лесной массив за домом, знакомятся с местными жителями и маленькими духами, которые раньше никто не замечал.